در نهایت، مشخص نیست که چرا برخی افراد دچار آفت می‌شوند در حالی که برخی دیگر این‌گونه نیستند. برخی بر این باورند که استعداد ابتلا به آفت‌های شانکر ارثی است،ت  در حالی که برخی دیگر معتقدند عوامل خاصی بر تعداد دفعات ابتلا به آن‌ها تأثیر می‌گذارند. چند علت مشکوک برای آفت‌ها عبارتند از:

ضربه به مخاط دهان: خواه گاز گرفتن گونه، یا بریدگی براکت‌ها یا مسواک زدن بیش از حد دندان‌هایتان، هر یک از این موارد می‌تواند باعث ایجاد زخم دهان شود.

حساسیت غذایی: برخی از زخم‌ها توسط غذاهای اسیدی موجود در مرکبات، گوجه فرنگی و حتی قهوه ایجاد می‌شوند.

کمبود ویتامین: داشتن سطوح پایین B-12، اسید فولیک، آهن یا روی ممکن است باعث ایجاد زخم در دهان شود.

انواع خمیر دندان یا دهان شویه: ثابت شده است که استفاده از خمیر دندان یا دهانشویه با سدیم لوریل سولفات باعث تحریک پوشش دهان و لثه می‌شود.

تغییرات هورمونی: این می‌تواند بر نحوه جریان خون به بافت لثه تأثیر بگذارد، اما هم‌چنین بر نحوه پاسخ بدن به سموم تأثیر می‌گذارد. زنان به دلیل نوسانات هورمونی بیشتر مستعد ابتلا به مشکلات دهان و دندان و آفت می‌شوند.

بیماری خودایمنی: شرایطی مانند کولیت اولسراتیو، بیماری التهابی روده یا بیماری کرون ممکن است باعث شروع آفت شود.